Алгоритм відновлення випадково видаленого файлу в Netbeans:
1) в дереві "Проекты" зробити клік правою кнопкою, по теці, з якої був видалений файл
2) вибрати "История"->"Откатить удаление".
3) відмітити видалений файл та натиснути "ОК"
Думаю, що це спрацює тільки якщо включено ведення локальної історії в Netbeans.